Porque ao criar Anúncios a partir de Produtos o meu SKU não é repassado ao marketplace?

Toda vez que você cria um novo Anúncio à partir de um Produto, o Mercado Livre entende que trata-se de algo novo, totalmente independente e para isso, atribui um MLB específico que seria a identificação deste Anúncio. 

Logo, o SKU entra como um atributo do Anúncio e deve ser preenchido na aba que se destina esta edição dentro da tela Mercado Livre > Gerenciar Anúncios > Editar Anúncios.

Esta aba é disponibilizada assim que a categoria é definida no próprio menu Home > Mercado Livre > Gerenciar Anúncios > Criar Anúncios à Partir de Produtos, você só precisa abrir o campo para incluir e preencher com o seu código.